מסלול ‘יחד’ הפועל בביה”ס, מטמיע את עקרונות החינוך המשלב, הרואה ביהדות הפלורליסטית גורם מאחד ולא מפריד, השואף לחיים משותפים, זה לצד זה חילוניים, דתיים ומסורתיים- מכל קשת הדעות והתפיסות.
במסלול ‘יחד’ מתקיימות שגרות למידה של החינוך המשלב, בו ניתן תגבור של לימודי יהדות וציונות בתוספת לתכנית הלימודים של החינוך הממלכתי. הלמידה היא למידה חוויתית יצירתית המשלבת בתכנית הלימודים ובאורחות החיים לימוד מקורות יהודיים בהיקף רחב וקיום פעילויות חווייתיות, תוך שימת דגש על חינוך לסובלנות לדעות, זרמים ואורחות חיים בתרבות היהודית וקיום חיים משותפים בין החלקים השונים בחברה.
בביה”ס ניצנים, בשל היותו בית ספר המטמיע חווייה בדרך עבודתו, קיימות פלטפורמות ייעודיות המאפשרות לקיים את עקרונות החינוך המשלב כלימוד המתבסס על חוויה, כגון:
למידה דרך מטבח, למידה מבוססת פרויקטים, שילוב החשיבה המתמטית ומרחב אקולוגי.
בנוסף, מסלול “יחד ניצנים” מהווה הזדמנות משמעותית לייצר חוויה אמיתית של חיים זה לצד זה של זרם משלב לבין קהילה השייכת לזרם הממלכתי וכך לממש הלכה למעשה ההזדמנות לחיים בצוותא לצד מתן מקום לזהויות שונות בחברה הישראלית.
